儿科是常熟市第二、三、四周期临床重点专科。目前分设儿内科和新生儿科，包括本部院区17病区（儿内科40张、新生儿科10张）、33病区（儿内科27张），滨江院区68病区（儿内科14张），共计床位91张，年门急诊人数19.7万人次，出院人数6100人次。科室共有医师36人，其中，主任医师5名，副主任医师7名，主治医师13名，住院医师11名，硕士研究生8名，教授1名、副教授4名。护士36人，其中，主管护师6人，初级30人。曾获常熟市科学进步三等奖6项，新技术引进奖3项，目前在研究中4项。发表论文100余篇，其中中文核心杂志发表30余篇。2014年度获常熟市优质护理病区。
       开设新生儿、哮喘、血液、肾脏免疫、心血管、神经、消化、内分泌、儿童保健、高危儿等专科及专家门诊。能够常规开展儿科各亚专科的一般技术和项目，神经、内分泌遗传代谢、新生儿、呼吸专业等专业可开展重点技术和项目，与金域检验合作开展部分疑难、少见病的诊治。2010年2月成功完成在呼吸机辅助通气情况下重症高胆红素血症合并先天性心脏病的小婴儿动静脉双通道同步换血治疗。2011年7月救治双胎超早产儿（28周，体重0.8kg ）合并先心（ASD+PDA）2例，并开展了超极低体重儿深静脉置管（PICC）。
       科室先进设备：德国海伦（Leoni+）集无创、常频、高频振荡通气为一体的婴幼儿呼吸机1台、Fisher-paykel 无创CPAP呼吸机1台、科曼NV8双水平无创CPAP 呼吸机1台、长颈鹿光纤蓝光灯1台、韩国BT-400冷光源蓝光灯2台，德尔格C2000暖箱1台、韩国CHS-i1000暖箱1台，科曼C60呼吸暂停自动唤醒监护仪1台。